Programma per la scrittura di reazioni chimiche. Schema chimico in Word di composti organici

Compito.

Le formule organiche complesse sono piuttosto laboriose nel disegnarle con i soliti metodi WORD. Per risolvere questo problema, sono stati creati speciali editor chimici. Differiscono nella specializzazione e nelle loro capacità, nel grado di complessità dell'interfaccia e nel lavoro in esse, ecc. In questa lezione dovremmo conoscere il lavoro di uno di questi redattori preparando un file di documento con le formule necessarie.

Caratteristiche generali dell'editor ChemSketh

Redattore chimico ChemSketch dal pacchetto software ACD / Labs dell'azienda canadese "Advanced Chemistry Development" in termini di funzionalità non è inferiore all'editor ChemDraw e in qualche modo lo supera addirittura. A differenza di ChemDraw (dimensione della memoria 60 megabyte), ChemSketch occupa solo circa 20 megabyte di spazio su disco. È anche importante che i documenti creati utilizzando ChemSketch occupino una piccola quantità, solo pochi kilobyte. Questo editor chimico è più focalizzato sul lavoro con formule organiche livello medio di complessità (c'è una vasta libreria di formule già pronte), ma è anche conveniente comporre formule chimiche di sostanze inorganiche. Può essere utilizzato per ottimizzare le molecole nello spazio 3D, calcolare le distanze e gli angoli di legame tra gli atomi in una struttura molecolare e molto altro.

. Oggi nei commenti mi è stata posta una domanda: - Come disegnare effetti mesomerici nei composti organici in Word? Francamente parlando, in chimica capisco come un ariete nella Bibbia. Ma, come si suol dire, "ho afferrato il rimorchiatore - non dire che non è pesante". Ho cercato su Internet che tipo di "bestia" sia - l'effetto mesomerico, e ho deciso di descrivere la creazione di una tale formula usando l'esempio dell '"effetto mesomerico dei sostituenti". Come si è scoperto, non c'è nulla di complicato nella creazione di una formula del genere. Sebbene per tali scopi sia meglio utilizzare programmi speciali che probabilmente si trovano su Internet. Ma poiché chiedono di mostrare nella Parola, lo faremo nella Parola.

Schema chimico inParolacomposti organici

Per disegnare un tale diagramma in Word, dobbiamo richiamare l'articolo. Se qualcosa non è chiaro, vai a vedere. Nel frattempo, affrontiamo la descrizione della creazione di un circuito chimico.

Poniamo il cursore sul documento, nel punto in cui vogliamo posizionare il nostro schema. Selezionare nella parte inferiore della finestra sul pannello Disegno attrezzo Rettangolo e cliccaci sopra con il mouse.

Avremo una tale cornice vuota del nostro schema futuro. È in esso che lo creeremo.


Andiamo sullo stesso pannello Disegno negli strumenti AutoForme, e scegli lì diagramma a blocchi- figura Preparazione.

Facciamo semplicemente clic su questa figura con il mouse, quindi andiamo nella nostra tela e facciamo clic con il mouse nel punto in cui vogliamo posizionare il primo elemento della formula. Quindi tutto questo può essere spostato.

Ora dobbiamo espandere questa forma e cambiarla un po'. Sposta il cursore del mouse sul cerchio verde. Una freccia nera circolare apparirà attorno a questo cerchio. Senza rilasciare il tasto, ruotiamo la figura spostando il mouse sul tavolo finché la figura non ruota come ci serve.

Ora puoi rilasciare la chiave. Quindi portiamo il cursore sul cerchio bianco destro (prenderà la forma di una freccia a due punte), e ancora una volta, senza rilasciare il tasto, allunghiamo leggermente la figura a destra.

Negli strumenti AutoForme scegliere Linee di collegamentoLinea di collegamento diretta.

Torniamo di nuovo al nostro pezzo, spostiamo il cursore nella parte superiore della figura, combiniamo il cursore con il cerchio della parte superiore (prima selezioniamo la figura facendo clic su di essa) e, senza rilasciare il pulsante sinistro del mouse, trasciniamo la linea verso l'alto.

Realizzeremo delle linee all'interno della figura con uno strumento Linea.

Facciamo clic su questo strumento e andiamo alla nostra figura. Voglio dire subito che le linee all'interno della figura non sono facili da realizzare, quindi la disegneremo dall'esterno e la sposteremo all'interno. Per comodità, puoi ingrandire il documento.

È meglio tracciare una linea parallela con il tasto Alt premuto. Non disegnarlo a lungo, altrimenti si attaccherà a qualche pennarello durante il trasferimento (cerchi sulla figura selezionata) e dovrai crearlo di nuovo. In generale, questo processo si è rivelato il più laborioso. Non funzionerà senza pratica.

Dopo aver creato la linea, sposta il cursore su di essa e quando assume la forma di una croce con le frecce alle estremità, premi pulsante di sinistra mouse e, senza rilasciarlo, sposta la linea all'interno della figura, più vicino alla faccia laterale. Non cercare di avvicinare troppo la linea: si attaccherà alla faccia laterale.

Dopo ogni tentativo fallito, è necessario fare nuovamente clic sullo strumento Linea. Ci sono riuscito in cinque tentativi. E non dimenticare di tenere premuto il tasto alt quando si disegnano linee oblique.

Bene, abbiamo fatto la parte più difficile.

Ora combineremo tutte le nostre forme e linee in una sola. Per fare ciò, seleziona ogni elemento con un clic del mouse mentre tieni premuto il Ctrl come nella mia foto. Ogni forma dovrebbe avere dei pennarelli.

Fai clic con il tasto destro del mouse all'interno della forma principale (in modo che le maniglie non scompaiano) e seleziona dal menu a discesa − raggruppamentoGruppo.


Ora questa forma può essere spostata e copiata.

Consiglio.

Crea questi disegni in un documento separato e salva come modello. Quindi dovrai semplicemente copiare l'immagine necessaria, incollarla nel documento e aggiungervi delle formule.

Poiché abbiamo bisogno di più di uno di questi elementi, lo copieremo e sposteremo la copia in un'altra posizione.

Fare clic con il tasto destro all'interno della forma e selezionare copia.

Ora fai clic con il pulsante destro del mouse su qualsiasi posto non occupato nello schema futuro e seleziona Inserire.


Trascinalo con il mouse dove vuoi.


Ora iniziamo a scrivere le formule e il titolo dello schema.

Strutture edilizie

ChemOffice Ultra 2005 v.9.0 (commerciale)

La suite di chimica ChemOffice Ultra è composta da diversi programmi – disegno chimico,Chem3D, ChemFinder, ChemFinder per Office.

1. ChemDrawil più famoso e popolare programma creato appositamente per la costruzione di formule strutturali di sostanze organiche e inorganiche. Contiene una tavola periodica incorporata, crea spettri NMR e PMR calcolati per varie sostanze, genera i nomi delle sostanze in base alle loro formule strutturali, contiene un ampio database di modelli di strutture chimiche.
2. Chem3D
un programma per la creazione e la visualizzazione di strutture chimiche tridimensionali, ha un plug-in ChemDraw integrato, che consente di costruire una struttura chimica tridimensionale utilizzando una formula strutturale scritta sullo schermo. Inoltre, il programma calcola le proprietà fisiche delle strutture chimiche utilizzando vari metodi di chimica quantistica (MM3, MOPAC, metodo Hückel, ecc.).
3. Ricerca chimica
un programma che permette di visualizzare e creare database di strutture chimiche.
4. ChemFinder fo ufficio
è uno strumento molto utile per trovare strutture chimiche nei documenti Microsoft Office (*.rtf, *.doc, *.xls ecc.), archivi di strutture chimiche. Supporta molti dei formati più comuni, trova facilmente qualsiasi struttura chimica sul tuo computer.

ChemWindow 5.1 (software gratuito) / 6.0 (Commerciale)

Il kit di installazione contiene quattro programmi– chemwin, SymApps, ChromKeeper, IRKeeper.

1. ChemWinprogramma per la creazione di formule di struttura. Può convertire automaticamente catene di carbonio acicliche in formule strutturali con firme e viceversa. Sulla base della formula di struttura, ChemWin determina la formula molecolare, la composizione di massa del composto, ecc. Contiene una discreta libreria di apparecchiature di laboratorio (nella cartella ...\ChemWin\Libraries) e una libreria che contiene molte strutture chimiche.
2. SymApp
programma per la visualizzazione di modelli volumetrici e ball-and-stick di molecole. Vari elementi di simmetria sono chiaramente visibili: assi, piani di simmetria, ecc., Che non è, ad esempio, in Chem3D Ultra. Il programma può calcolare tabelle di caratteri, determinare gruppi di punti di molecole.
3. ChromKeeper, IRKeeper
programmi per lavorare con spettri sperimentali.

Chim Draw Pro 11.0.1 (commerciale)

ChemDraw Pro 1 1.0.1un noto programma che ti consente di costruire qualsiasi struttura chimica. Contiene una tavola periodica incorporata e molti modelli di strutture chimiche. Versione moderna ChemDraw Pro ha diversi stili visivi (i cosiddetti Argomenti), tra cui I_Draw Stile, che ricorda il noto programma ISIS/Draw (vedi sotto). Puoi cambiare il tema nelle opzioni del programma.

Symyx Draw 3.1 (FreeWare)

Simixe Disegno n è un programma ISIS/Draw attentamente rivisto e ridisegnato (vedi sotto). Symyx Draw salva i file in formati*.skc, *. mol , *.smi , nonché *.bmp, *.png, ecc. Genera automaticamente i nomi delle sostanze (secondo la nomenclatura IUPAC). Il programma ha una caratteristica unica che non è disponibile in altri cassetti: ti consente di creare modelli personalizzati sulla barra degli strumenti. Disegna una molecola e trascinala semplicemente sul pannello, fai doppio clic sull'icona: si aprirà una finestra in cui puoi impostare impostazioni necessarie- il nome del modello, atomo "estremo" e legame attaccato ad un'altra molecola (cliccandoci sopra).

Sorteggio ISIS 2.4 / 2.5 (Gratuito)

Assolutamente programma gratuito per disegnare formule di struttura. I file vengono salvati nel formato *.skc (ISIS/Draw Sketch), facilmente riconoscibile dal programma ChemDraw. A sua volta, utilizzando il programma ChemDraw, è facile salvare il file nel formato ISIS/Pareggio . Pertanto, non vi è alcuna perdita di dati, che è molto importante quando si trasferiscono strutture da un formato all'altro (* .cdx -> *.skc ). La versione 2.5 è simile alla versione 2.4, ma non contiene aggiunte.

ChemPen 1.9.0.9 (ShareWare)

Programma molto facile da usare per disegnare strutture chimiche. Le strutture possono essere copiate negli appunti e quindi incollate in documenti Microsoft Word o PowerPoint. Utile per uso personale(per la creazione di abstract, report, presentazioni, ecc.), ma è meglio non utilizzarlo per pubblicazioni su riviste scientifiche e case editrici, poiché ChemPen non supporta i formati comuni (*.cdx e *.skc). Va notato che il pacchetto di installazione è piccolo (solo 1,3 MB).

ChemSketchv. 12.01 (Freeware)

Versione russa assolutamente gratuito programma per disegnare strutture chimiche. Ha un'interfaccia user-friendly composta da due finestre: " Struttura" E " Disegno". La prima finestra serve per rappresentare le strutture, la seconda per disegnare reazioni chimiche e vari schemi. Il programma contiene una tabella molto utile di radicali, modelli di anelli, catene e gruppi funzionali e altri strumenti. In molti modi, il programma non è inferiore a ChemDraw e ISIS/Pareggio, può salvare i file in entrambi i formati: ChemDraw Document (*.cdx) e Sketch ISIS/Draw (*.sk C). Oltre a ChemSketch, il pacchetto di installazione include anche un visualizzatore 3D, un programma che consente di creare modelli tridimensionali di molecole.

CarboDraw 1.0 (FreeWare)

Un programma speciale progettato per costruire strutture cicliche di carboidrati (mono-, oligo- e polisaccaridi). I monosaccaridi possono essere collegati in catene, formando un polisaccaride di una data composizione. Qualsiasi monosaccaride può essere rappresentato come un isomero D o L. C'è la possibilità di scegliere numerosi sostituenti (invece di gruppi idrossilici e atomi di idrogeno). I nomi dei monosaccaridi vengono impostati automaticamente, possono anche essere modificati manualmente.

Caratteristiche generali dell'editor ChemSketh

Redattore chimico ChemSketch Si concentra sul lavoro con formule organiche di livello medio di complessità (esiste un'ampia libreria di formule già pronte), ma è anche conveniente comporre formule chimiche di sostanze inorganiche. Può essere utilizzato per ottimizzare le molecole nello spazio 3D, calcolare le distanze e gli angoli di legame tra gli atomi in una struttura molecolare e molto altro.

Il programma ChemSketch contiene anche strumenti per la creazione di immagini vettoriali, per molti versi simili all'editor vettoriale di Microsoft Office, quindi consente di creare illustrazioni grafiche. La creazione di formule e disegni complessi è facilitata dalla presenza di un album di modelli per formule e disegni, che può essere rifornito dall'utente. Gli oggetti creati utilizzando l'editor possono essere salvati, stampati e anche copiati su WORD e altre applicazioni.

Sarà utile anche il calcolatore ChemSketch integrato, che consente di calcolare molte caratteristiche delle sostanze le cui formule vengono create nell'editor.

Lancio e finestra di lavoro programmi

Durante l'installazione, è possibile specificare la cartella del computer in cui si troveranno i file del programma e la sezione del menu principale (ACDLabs per impostazione predefinita) in cui si troverà il suo collegamento. Per comodità, puoi creare un collegamento al programma sul desktop. Dopo aver installato il pacchetto software, è possibile avviare l'editor nei due modi seguenti.

    Sul menu Start-Programmi selezionare il sottomenu ACDLabs… e poi ChemSketch.

    Sul desktop, fai doppio clic sul collegamento ChemSketch con il tasto sinistro del mouse.

Se stai eseguendo ChemSketch sul tuo computer per la prima volta dall'installazione, potrebbe apparire una finestra di dialogo Associazioni di file. Usa questa finestra per collegare i file creati in ChemSketch a Windows. Dopo questa operazione sarà possibile lanciare ChemSketch facendo doppio clic sul file corrispondente.

Potrebbe anche apparire una finestra di dialogo. Consiglio del giorno(Suggerimento del giorno), che può essere chiuso immediatamente o dopo aver letto le raccomandazioni. Se non sei un grande conoscitore della lingua inglese, puoi deselezionare la casella in modo che l'editor non ti "infastidisca" con consigli ogni volta che lo avvii.

La finestra di lavoro del programma contiene la riga Menù e due barre degli strumenti (alcuni comandi e pulsanti saranno disponibili solo quando inizi a creare una formula):


Barra degli strumenti Standard, situato sotto la barra dei menu, contiene pulsanti che consentono di eseguire rapidamente comandi comuni come il salvataggio e l'apertura di file, l'annullamento e la ripetizione di un'azione, l'eliminazione, il taglio e la copia di un frammento, il ridimensionamento e una serie di comandi specifici. Questo pannello contiene anche pulsanti Disegno della struttura per cambiare la modalità editor.

L'editor di ChemSketch funziona in due modalità: struttura(Struttura) e Disegno(Disegno), diverso per scopo e set di strumenti. Per passare da una modalità all'altra, è necessario fare clic sul pulsante corrispondente.

In modalità Struttura vengono create formule molecolari e strutturali di sostanze, schemi ed equazioni di reazioni. Modalità disegno conveniente per inserire blocchi di testo, creare tabelle, diagrammi, richiami, oggetti grafici non standard e per convertirli.

In modalità Struttura, è presente una barra degli strumenti sopra l'area di lavoro strutture. Contiene pulsanti di comando per creare e lavorare con formule chimiche. In modalità disegno al posto di questo pannello è attiva la barra degli strumenti per lavorare con gli oggetti grafici.

Pannello atomi situata a sinistra dell'area di lavoro. Include una tabella di D.I.Mendeleev, pulsanti che visualizzano atomi e strumenti per registrare le proprietà di un atomo (carica, valenza, numero, ecc.). Attivo solo in modalità Struttura. In modalità disegni invece di questo pannello, il pannello è attivo AutoForme.

Pannello Radicali situata a destra dell'area di lavoro. Contiene una tabella di radicali, costituita da vari pulsanti che rappresentano radicali già pronti. Mentre lavori, sul pannello compaiono nuovi pulsanti che corrispondono ai radicali utilizzati. Questo pannello è attivo solo nella modalità Struttura.

L'area di lavoro è una pagina vuota. Documento ChemSketchè costituito da una o più pagine che possono essere create, copiate, cancellate tramite i comandi di menu Pagine. Sì, il comando del menu Pagine Nuovo(Pagine-Nuovo) aggiunge nuova pagina nel documento. La barra di stato indica il numero totale di pagine, il numero della pagina di lavoro e sono presenti pulsanti per spostarsi da una pagina all'altra.

Sotto l'area di lavoro c'è Tavolozza colori e una stringa stati, che contiene informazioni di riferimento: il nome del file creato (modificato), il numero di pagina nel file, il numero di strutture chimiche nell'area di lavoro, la formula molecolare e la massa del frammento selezionato della struttura.

IO Esegui ChemSketch, esamina gli elementi della finestra di lavoro, il loro cambiamento quando si cambia modalità. Aggiungi e rimuovi pagine.

Impostazioni del programma

È possibile impostare i parametri dell'editor utilizzando il menu Opzioni, in particolare il comando Preferenze(Opzioni). Qui sulla scheda Generale(Generale) è possibile rendere visibili o invisibili alcuni elementi della finestra di lavoro, come righelli (Ruller), layout di pagina con punti (Grid). Qui puoi anche impostare le cartelle in cui verranno archiviate le tue impostazioni, i file di configurazione e i documenti. Se desideri che i tuoi documenti ChemSketch vengano archiviati in una cartella specifica, puoi farlo come segue:

    Nella finestra di ChemSketch, seleziona il menu del programma Opzioni(Opzioni), elemento Preferenze(Opzioni).

    Nella finestra che si apre, seleziona la scheda Generale(Sono comuni).

    In campo Predefinito(Impostata per impostazione predefinita) Specificare la cartella in cui verranno archiviati i documenti creati dall'utente nel programma.

    In campo Privato(Personale) Specificare la cartella in cui verranno archiviate le impostazioni del programma, i file di configurazione ei file temporanei.

Nelle altre schede della finestra Preferenze ( Pulizia della struttura-reazione) è possibile impostare i parametri per disegnare e ottimizzare formule, equazioni di reazioni chimiche. È meglio per un utente inesperto lasciare le impostazioni predefinite.

Barre degli strumenti ultima versione ChemSketch può essere personalizzato utilizzando il menu contestuale.

IOProva gli elementi di installazione di ChemSketch, imposta la cartella per il salvataggio dei documenti nella cartella del desktop. Risparmia per ora file vuoto sotto il nome Formula: menu File-Salva con nome (File-Salva con nome).

Creazione di strutture di idrocarburi

Le formule dei composti vengono create nella modalità Struttura, la base della formula di un composto organico è la struttura dell'idrocarburo. Ci sono tre strumenti per disegnarlo nell'editor: Disegna Normale(Disegna normalmente) Disegna continuo(Disegna continuamente) e Disegna catene(Tira le catene). Per disegnare esattamente le strutture degli idrocarburi, oltre a scegliere uno strumento, è necessario selezionare il simbolo di un atomo di carbonio sul pannello dell'atomo.

Attrezzo Disegna Normale ogni volta che si fa clic su uno spazio vuoto della pagina, viene creata la formula per il metano CH 4 . Crea una formula di etano con lunghezza arbitraria quando viene trascinata Connessioni C-C. Quando si fa clic su un atomo di carbonio esistente, crea un ramo aggiungendo un gruppo metilico -CH 3 con una lunghezza di legame standard. Facendo clic successivamente sugli atomi di carbonio terminali, è possibile creare strutture di idrocarburi arbitrariamente grandi. In questo caso, di solito vengono mostrati solo gli atomi di carbonio terminali (terminali). Gli atomi di carbonio interni (e i loro atomi di idrogeno associati) sono rappresentati da nodi di polilinee o dai loro punti di giunzione e diventano visibili solo al passaggio del mouse.

Attrezzo Disegna continuo quando si fa clic su uno spazio libero della pagina, viene creata la formula per il metano CH 4 . Ad ogni clic successivo su un punto vuoto, allunga la catena attaccando un nuovo gruppo -CH 3 al precedente atomo di carbonio. Questo crea strutture con lunghezze di legame arbitrarie e disposizione arbitraria degli atomi C-C. Quando fai clic su un atomo di carbonio esistente, diventa attivo e la catena continuerà da lì. Un doppio clic crea un ramo standard aggiungendo un gruppo metilico -CH 3 con una lunghezza di legame standard.

Attrezzo Disegna catene quando viene cliccato, si comporta come uno strumento Disegna Normale, ma disegna una catena di idrocarburi standard come una linea a zig-zag quando viene trascinata. Accanto al puntatore del cursore appare un numero che indica il numero di atomi di carbonio nella catena. La catena può anche essere avviata da qualsiasi atomo di carbonio esistente.

Se è necessario accorciare la catena, si possono rimuovere uno alla volta gli atomi di carbonio e quindi metile o metilene e altri gruppi. Per fare ciò, fare clic sul pulsante Eliminare(Elimina) sulla barra degli strumenti standard e fare clic successivamente sugli atomi che si desidera eliminare. È possibile utilizzare il pulsante se necessario. Disfare(Annulla)

Connessioni multiple. Qualsiasi strumento di disegno, quando fai clic su una linea di collegamento, convertirà un singolo collegamento in un doppio collegamento, quindi in un triplo collegamento e quindi di nuovo in un singolo collegamento. In accordo con il cambiamento nella molteplicità del legame, il numero di atomi di idrogeno cambia. Un doppio legame non verrà creato se la ramificazione all'atomo di carbonio lo impedisce, e anche se la formula è completamente espansa.

IO Usando diversi strumenti, crea la formula per 2,2-dimetilpropano, 2-metilpentano, 2-metil-5-butildecano. Disegna le formule dei composti insaturi: butino-2 e 2-metilbutadiene-1,3. Salvare il file (menu File-Save (File-Save) o pulsante sul pannello Standard)


Trasformazione vista Struct

L'aspetto delle strutture create può essere modificato spostandole, ruotandole, modificando la posizione degli atomi e dei gruppi di atomi, le lunghezze dei legami e le dimensioni della struttura nel suo complesso. Per fare questo, c'è una serie diversificata di strumenti nel pannello Struttura.

Per spostare una formula o i suoi elementi, utilizzare lo strumento Seleziona/Sposta(Seleziona/Sposta). Successivamente, puoi prendere qualsiasi carattere o linea di collegamento e modificarne la posizione sul foglio. Puoi inquadrare una parte della struttura o l'intera struttura, quindi spostare il luogo selezionato in una nuova posizione con il mouse.

Attrezzo Seleziona/Dimensione/Rotazione(Seleziona / Dimensione / Rotazione) consente di ruotare la formula nel piano tenendo uno degli atomi. Se circondi la formula (o il suo frammento) con una cornice, appariranno i quadratini di ridimensionamento. Infine lo strumento rotazione 3d permette di simulare la rotazione della formula nello spazio.

Il successivo gruppo di strumenti consente di modificare la posizione della formula sulla relazione selezionata. Ad esempio, se desideri che la formula venga ruotata in modo che alcune relazioni diventino verticali, devi:

    scegli uno strumento Imposta Bond verticalmente(impostare il collegamento verticalmente),

    fare clic sulla linea di collegamento

I pulsanti funzionano allo stesso modo. Imposta Bond orizzontalmente(collegare orizzontalmente) e Capovolgi Bond(riflettere per collegamento).

Bottoni Flip...(riflessioni dall'alto verso il basso e da sinistra a destra) richiedono una selezione preliminare della struttura desiderata. In caso contrario, verrà riflesso l'intero contenuto della pagina.

Pulsante Cambiare posizione consente di modificare la posizione dei simboli dell'atomo di idrogeno rispetto all'atomo di carbonio della struttura.

La modifica manuale della forma di una struttura può portare a risultati indesiderati. Per passare rapidamente alla struttura standard, puoi utilizzare lo strumento struttura pulita("pulizia" della struttura) - in sostanza, si tratta di un'ottimizzazione bidimensionale della struttura - allineamento delle lunghezze e degli angoli dei legami. C'è anche uno strumento di ottimizzazione 3D Ottimizzazione 3D. Quando viene eseguita questa operazione, la formula è completamente espansa.

Puoi anche espandere e comprimere gli atomi di idrogeno in una struttura di idrocarburi utilizzando i comandi del menu Strumenti - Aggiungi idrogeni espliciti E Rimuovi idrogeni espliciti. Se non è selezionato alcun frammento sul foglio, tutte le strutture del foglio vengono espanse.

IOUtilizzando gli strumenti descritti, raddoppiare all'incirca le dimensioni della formula 2,2-dimetilpropano. Modifica le altre formule che hai creato e la loro posizione per adattarle al meglio alla pagina. Aggiungi la formula strutturale dell'etano completamente espanso alla pagina.

Cicli e strutture aromatiche.

I cicli sono convenienti da disegnare con uno strumento Disegna continuo, mentre per chiudere il ciclo si fa l'ultimo click sul primo atomo di carbonio. Per i cicli con un numero elevato di atomi di carbonio, puoi utilizzare un altro metodo: utilizzare lo strumento Disegna catene disegna una catena con il numero desiderato di atomi di carbonio, quindi usa Disegna Normale, collega il primo atomo all'ultimo. Di conseguenza, si ottengono cicli non ottimizzati costituiti da una riga. Per presentarli nella forma corretta, utilizzare lo strumento struttura pulita.

In qualsiasi atomo di carbonio del ciclo, è possibile creare un ramo, una catena laterale e, chiudendolo in un ciclo, creare una struttura con cicli condensati, ad esempio la struttura dell'idrocarburo C 10 H 16 - adamantano. Se lo desideri, puoi dispiegare gli atomi di idrogeno della struttura ciclica.

Utilizzando i soliti metodi, i legami del ciclo possono essere convertiti in legami doppi o tripli (gli atomi di idrogeno devono prima essere piegati). Di conseguenza, il ciclo di sei atomi del cicloesano può essere convertito nella formula di Kekule per la molecola del benzene.

Per convertire la formula di Kekule in una struttura aromatica, usa il comando di menu Strumenti - Mostra Aromaticità(mostra aromaticità), l'operazione inversa viene eseguita dal comando Nascondi Aromaticità.

IODisegnare e ottimizzare le formule di ciclopropano, ciclopentano, cicloesano, benzene, naftalene, evidenziando la presenza di un legame aromatico delocalizzato negli ultimi due.

Copia strutture. Modello istantaneo.

La struttura selezionata può essere copiata negli appunti utilizzando il comando di menu Modifica-Copia, Ctrl-C o pulsanti della barra degli strumenti. La struttura copiata può essere incollata nei soliti modi in documenti in altri programmi, come un documento WORD, così come su qualsiasi pagina di un documento ChemSketch.

Quando si incolla in ChemSketch ( Modifica-Incolla, Ctrl-V o pulsante) un modello di struttura è attaccato al cursore. Quando fai clic sul punto giusto della pagina, viene visualizzata una copia della struttura. Le strutture possono anche essere copiate trascinandole tenendo premuto il tasto Ctrl.

In ChemSketch, c'è un altro modo per copiare le strutture: creare un modello istantaneo basato su di esse. C'è un pulsante sulla barra degli strumenti per questa operazione. Modello istantaneo(Modello istantaneo). Cliccando su questo pulsante, si deve poi cliccare su uno degli atomi o su uno dei legami della struttura selezionata. Il modello della struttura è attaccato al cursore e può essere utilizzato per inserire copie della struttura tutte le volte che è necessario (ma solo in). Per "sganciare" il modello dal puntatore del mouse, fare clic bottone giusto mouse o il tasto Esc.

Il modello istantaneo può essere utilizzato non solo per copiare le strutture, ma anche per completarle. In questo caso, è importante per quale atomo o per quale legame viene preso il modello, poiché è attraverso questo legame o attraverso questo atomo che il modello si unirà a un'altra struttura. Quindi, per ottenere la formula del difenile dalla formula del benzene, hai bisogno di:

Se invece dalla formula del benzene è necessario ricavare la formula del naftalene, allora occorre:

    Fare clic sul pulsante Modello istantaneo;

    Clicca su uno di connessioni nella formula del benzene (prendi il modello dal legame);

    Sposta il cursore su uno di connessioni nella stessa o in un'altra formula benzenica e fare clic: gli anelli fenilici si collegheranno lungo questo legame, formando una struttura naftalenica condensata.

Va tenuto presente che quando si uniscono strutture aromatiche, può verificarsi una perdita di aromaticità. Inoltre, possono sorgere strutture con un atomo di carbonio pentavalente. Tali atomi "sbagliati" sono contrassegnati come errati incrociandoli con una croce. Per evitare tali problemi, puoi fare quanto segue: rimuovere l'aromaticità e i legami multipli dalle strutture originali; - combinare le strutture; - riorganizzare i legami multipli e mostrare l'aromaticità (menu Strumenti - Mostra Aromaticità).

IO Crea una nuova pagina e copia su di essa le formule per 2,2-dimetilpropano e 2-metilpentano, benzene, naftalene. Usa il modello istantaneo per trasformare la formula del benzene in una formula difenile. Allo stesso modo, sulla base della copia della formula per il naftalene, crea la formula per il fenantrene.

Sostituenti ed eteroatomi

Per passare dagli idrocarburi alle formule di altre classi di composti organici, è necessario imparare a introdurre nella formula i simboli di altri elementi chimici. Per fare ciò vengono utilizzati gli stessi strumenti di disegno, solo che devono prima essere "caricati" con il simbolo dell'elemento desiderato cliccando su questo simbolo sul pannello atomi. Invece del simbolo di un elemento specifico, puoi scegliere il simbolo di qualche atomo (pulsante Qualsiasi Atomo). Se il simbolo dell'elemento desiderato non è sul pannello, puoi aprire la tavola periodica e selezionare il simbolo dalla tabella. Allo stesso tempo, verrà posizionato sul pannello. atomi. La tavola periodica contiene anche brevi informazioni sugli elementi chimici (scoperta, costanti di base, struttura atomica...).

Esistono due modi per introdurre gli eteroatomi: sostituire i simboli del carbonio con un altro simbolo dell'elemento e collegare il simbolo dell'elemento a una struttura già esistente.

Nel primo caso, viene utilizzato lo strumento Disegna Normale. Seleziona il simbolo dell'elemento desiderato e clicca sull'atomo di carbonio da sostituire. In questo caso, l'atomo non metallico viene integrato secondo la sua valenza con il numero richiesto di atomi di idrogeno, se il numero di legami supera la valenza, l'atomo viene inserito come ione. È conveniente creare formule di eterocicli in questo modo: prima viene disegnato un ciclo del carbonio, quindi uno degli atomi di carbonio viene sostituito da un eteroatomo.

Per aggiungere un simbolo, utilizzare lo strumento Disegna continuo. Selezionare il simbolo dell'elemento desiderato e fare clic sull'atomo di carbonio a cui deve essere collegato l'eteroatomo. Un secondo clic sopra o vicino a questo atomo aggiunge alla formula un simbolo non metallico con il numero richiesto di atomi di idrogeno. Se viene inserito un simbolo metallico con una valenza maggiore di 1, viene inserito come catione.

IO A pagina 2: disegna la formula per il propano e cambia gli atomi in etanolo. Allo stesso modo, dalla formula del 2-metilpentano, ottenere la formula dell'acido amminopropionico. Crea una copia della formula del cicloesano e convertila nella formula del diossano. Usando il secondo metodo, trasforma la copia della formula del benzene nella formula dell'o-fluoroanilina


Radicali e gruppi di atomi

Le molecole organiche contengono spesso alcuni gruppi funzionali, disegnarli ogni volta di nuovo non è razionale. Inoltre, alcuni frammenti di formule complesse sono spesso raffigurati non come formule strutturali, ma come piegati (-NO 2, -C 2 H 5) o addirittura simboli (Et, i-Pr, Ph). ChemSketch offre due strumenti per inserire tali frammenti nelle formule Radicali E Gruppi di atomi.

Essenzialmente sono la stessa cosa, ma se Radicali vengono inseriti come frammenti di formule strutturali, quindi Gruppi di atomi- come formule o convenzioni piegate. Dopo l'inserimento, i gruppi di atomi possono essere dispiegati, cioè convertiti in radicali (il processo inverso è impossibile).

Per inserire un radicale, devi trovarlo nella tabella dei radicali. Dopo aver fatto clic sul pulsante del radicale selezionato, il suo modello di struttura viene attaccato al cursore e può essere utilizzato come modello istantaneo. Il radicale usato appare nel pannello dei radicali, che ti permette di non cercarlo nella tabella la prossima volta che lo usi. Pertanto, per ottenere la formula di m-dinitrobenzene dalla formula del benzene, è necessario:

IOCopia la formula del benzene e usala per creare la formula m-dinitrobenzene.

Un gruppo di atomi in ChemSketch non è molto chiaro chiamato Etichetta dell'atomo("etichetta atomica", "etichetta atomica"). Lo strumento per la modifica e l'inserimento di un gruppo si trova nel pannello Atomi - pulsante Modifica etichetta Atom. Per aggiungere un gruppo di atomi, è necessario:

Per espandere un gruppo di atomi:

    Fare clic sul pulsante Modifica etichetta Atom;

    Fare clic su una formula o un simbolo di un gruppo di atomi, questo riaprirà la finestra di dialogo Modifica etichetta.

    In questa finestra, fare clic sul pulsante Espandere(Espandere)

Pulsante Espandere mancherà o non riuscirà ad espandere un gruppo di atomi se:

    Il gruppo non è collegato alla struttura o è collegato in modo errato;

    La formula del gruppo non è corretta, ad esempio, utilizzando le lettere dell'alfabeto russo invece del latino;

    La formula è troppo complessa o vengono utilizzati simboli non inclusi nel programma.

Quando si compilano e si modificano formule per gruppi di atomi, è inoltre possibile utilizzare i seguenti simboli:

"~" (tilde) carica negativa "+" carica positiva "-" legame singolo (può essere omesso) "=" doppio legame "%" (percentuale) triplo legame "()" (parentesi) gruppo ripetuto di atomi

Se un gruppo di atomi deve nuovamente essere rappresentato in forma compressa, dovrà essere nuovamente inserito (o utilizzare il pulsante Annulla.

ChemSketch ha anche uno strumento che ti permette di inserire simboli per radicali come R, R 1, ecc. - pulsante Etichette radicali.

IO Copia la formula del benzene e inserisci il gruppo SO al suo interno 3 H, prendendolo dall'elenco dei gruppi. Copia la formula del naftalene. Crea un nuovo gruppo di atomi (CH2)2COOMe. Attacca tali gruppi alle posizioni 2,7 della molecola di naftalene. Espandi i gruppi. Ottimizza la struttura (Pulisci struttura).


Maggiori informazioni sulle connessioni

Oltre ai legami ordinari e doppi, tripli nelle formule composti chimici potrebbe essere necessario rappresentare altri legami: coordinazione, idrogeno, sesqui... Un altro problema sorge quando è necessario mostrare la posizione dei legami nello spazio. Un altro gruppo di strumenti ChemSketch aiuta a disegnare formule spaziali e tipi speciali di relazioni.

Bottoni Legami stereo E Legami stereo verso il basso ti permettono di trasformare la solita formula in una spaziale. Per fare ciò, è necessario selezionarne uno, quindi fare clic rispettivamente sul collegamento diretto verso lo spettatore o lontano dallo spettatore. I legami che giacciono nel piano del foglio rimangono invariati.

Facendo clic successivamente su un collegamento stereo, è possibile modificarne l'aspetto, ma non saremo in grado di rappresentare un doppio, triplo collegamento. È possibile modificare gli strumenti Su a Giù e viceversa facendo clic con il pulsante destro del mouse su una parte vuota del foglio. Per tornare alla normale modalità di disegno, fare clic su Disegna Normale.

Donatore-accettore, idrogeno, legami di coordinazione sono indicati da frecce e linee tratteggiate. Il pulsante serve per disegnarli. Obbligazioni di coordinamento. Nell'angolo di questo pulsante è presente un triangolo luminoso, facendo clic su di esso si apre una tavolozza aggiuntiva che consente di selezionare il tipo di linea o freccia desiderato. Scegliendo lo strumento giusto, puoi disegnare un legame tracciando una linea da un atomo all'altro. È anche possibile disegnare il tipo di legame desiderato nello spazio vuoto, che aggiungerà un atomo alla fine del legame che era attivo sulla tavolozza degli atomi (quindi può essere sostituito). Puoi finalmente sostituire uno dei collegamenti nella struttura disegnata semplicemente cliccando con lo strumento selezionato sulla linea di collegamento.

Cliccando successivamente sul link, è possibile modificare la direzione della freccia e per tornare alla modalità normale è necessario fare clic con il tasto destro su una parte vuota del foglio o fare clic sul pulsante Disegna Normale.

Lo stesso funziona con il pulsante. Obbligazioni speciali, che consente di selezionare molti altri modi per rappresentare i legami chimici. L'aspetto del pulsante (e il relativo suggerimento) cambierà a seconda dello strumento selezionato.

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